论著
张俊涛, 杨幸怡, 余政梁, 赵 鹏, 刘大宇, 韩晓龙, 孙宏钰, 刘 超
录用日期: 2023-12-19
AGCU X Plus STR 复合扩增体系是一种可以同时检测 X 染色体 32 个基因座分型的新型荧光复合扩增体系,包括 DXS6807,DXS9895,X 染色体连锁群 1(DXS10148, DXS10135, DXS8378),DXS9902,DXS6795,DXS6810,DXS10159,DXS10162,DXS10164,DXS7132,连锁群 2(DXS10079, DXS10074, DXS10075),DXS981,DXS6800,DXS6803,DXS6809,DXS6789,DXS7424,DXS101,DXS7133,GATA172D05 ,GATA165B12,连锁群 3(DXS10103, HPRTB, DXS10101),GATA31E08 和连锁群 4(DXS8377, DXS10134, DXS7423)。相较于传统试剂盒,它不但可以同时检测更多的 X 染色体基因座分型,提高系统检验效能,而且它还包含并考虑了基因座之间的连锁关系。为评估该体系在法医学鉴定中的应用效果,本研究根据 SWGDAM 验证指南,根据扩增电泳条件、种属特异性、灵敏度、抗抑制剂、精确性、可重复性、一致性、混合样本、Stutter 峰和群体多态性等指标对该体系进行全方位评估。结果表明,扩增体系的 DNA 模板量>62.5 pg 时,可获得全部的基因座分型结果。混合检材 DNA 模板量≥1∶3 也可获得完整的次要贡献者的基因分型。在群体多态性研究中,选自南方汉族的 209 名无关个体共获得 285 个等位基因,多态信息量(PIC)介于 0.272 1(DXS6800)~0.910 5(DXS10135)之间,平均值为 0.679 8。多态性信息量最为丰富的基因座是 DXS10135(PIC = 0.910 5),个体识别能力在男、女性群体中分别为 0.916 4、0.987 1。累积个体识别能力在男性及女性群体中均大于 0.999 999 999,在三联体和二联体案件中的累积平均排除概率均大于 0.999 999 999。在 125 名无关男性个体中存在 78 个不同的DXS10103-HPRTB-DXS10101 单倍型,单倍型多样性为 0.981 0。在考虑连锁的情况下,计算出的累积个体识别能力(TPD)、三联体和二联体累积平均排除概率相较未考虑连锁时无明显数量级变化。因此,该体系分型准确、可靠,系统检验效能相较传统试剂盒明显提高,可满足法医学实践的要求,可作为常染色体 STR 复合扩增体系进行法医学鉴定的有效补充。本研究获得的 209 名无关个体群体数据可为 X-STR 检验提供数据参考。