引用本文

徐颖, 马温华, 孙启凡, 吴飚, 林子清, 叶健. 广西瑶族和苗族人群18个STR基因座遗传多态性[J]. 刑事技术,2016,41(1): 74-76
XU Ying, MA Wenhua, SUN Qifan, WU Biao, LIN Ziqing, YE Jian. Genetic Polymorphism of 18 STR Loci in Guangxi Yao and Miao Population[J].
Forensic Science and Technology,2016,41(1): 74-76
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2.公安部物证鉴定中心 北京市现场物证检验工程技术研究中心,北京 100038
3.三江侗族自治县公安局, 广西 柳州 545500
* 通讯作者: 叶 健,主任法医师,博士,研究方向为法医遗传学。 E-mail:
yejian77@126.com; 林子清,主任法医师,博士,研究方向为法医遗传学。 E-mail:
lziqing@ccpc.Edu.cn
作者简介: 徐 颖,硕士研究生,研究方向为法医学物证方向。 E-mail: 13309814217@163.com
基金: 基本科研业务费课题(2013JB003); 公安部技术研究计划项目(2014JSYJA011)
中图分类号:DF795.2
文献标志码:B
文章编号:1008-3650(2016)01-0074-03
doi: 10.16467/j.1008-3650.2016.01.016
本文对广西瑶族、苗族人群进行18个常染色体STR基因座多态性检测。138份新鲜外周静脉血样, 分别为广西三江侗族自治县公安局采集的瑶族70份、苗族68份, 均来自知情无关个体; 采用QIAamp® DNA Blood Midi Kit试剂盒(Qiagen公司, 德国)提取血样DNA; 使用Nanodrop2000c(Thermo Scientific公司, 美国)将DNA定量; 所有样本应用DNATyperTM19试剂盒[1] (公安部物证鉴定中心, 北京)进行PCR扩增, 实验操作参照ABI 3130XL型遗传分析仪(ABI公司, 美国)的使用说明书进行, Genemapper 3.2软件进行STR数据分析。应用Power Stats(V12)分析软件[2]对群体数据进行统计处理, 得到18个STR基因座等位基因频率(见表1、表2)、杂合度(H) 、匹配概率(PM)、个体识别能力(DP)、多态信息总量(PIC)、非父排除率(PE)、累积个体识别能力(TDP) 、累积非父排除率(CPE) 等法医遗传学参数(见表3)。
表 1
Table 1
表 1(Table 1)
 表 1 广西瑶族人群18个STR基因座的等位基因频率(n=70) Table 1 The allele frequencies of 18 STR loci of Yao population in Guangxi(n=70)D5S818 | D8S1179 | D7S820 | CSF1PO | D2S1338 | D3S1358 | vWA | D19S433 |
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A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | 7 | 0.029 | 8 | 0.007 | 7 | 0.014 | 7 | 0.014 | 16 | 0.014 | 14 | 0.029 | 14 | 0.321 | 12 | 0.036 | 8 | 0.007 | 10 | 0.157 | 8 | 0.143 | 10 | 0.314 | 17 | 0.143 | 15 | 0.286 | 15 | 0.029 | 12.2 | 0.007 | 9 | 0.043 | 11 | 0.121 | 9 | 0.057 | 11 | 0.236 | 18 | 0.107 | 16 | 0.386 | 16 | 0.100 | 13 | 0.307 | 10 | 0.257 | 12 | 0.157 | 9.2 | 0.007 | 12 | 0.386 | 19 | 0.214 | 17 | 0.229 | 17 | 0.179 | 13.2 | 0.057 | 11 | 0.271 | 13 | 0.171 | 10 | 0.150 | 13 | 0.029 | 20 | 0.171 | 18 | 0.071 | 18 | 0.271 | 14 | 0.207 | 12 | 0.250 | 14 | 0.071 | 11 | 0.429 | 14 | 0.021 | 21 | 0.021 | D6S1043 | 19 | 0.086 | 14.2 | 0.121 | 13 | 0.136 | 15 | 0.236 | 12 | 0.179 | PentaE | 22 | 0.057 | A | F | 20 | 0.014 | 15 | 0.086 | 15 | 0.007 | 16 | 0.057 | 13 | 0.021 | A | F | 23 | 0.143 | 10 | 0.043 | D18S51 | 15.2 | 0.121 | D21S11 | 17 | 0.007 | D13S317 | 5 | 0.107 | 24 | 0.079 | 11 | 0.086 | A | F | 16.2 | 0.050 | A | F | 18 | 0.014 | A | F | 9 | 0.021 | 25 | 0.043 | 12 | 0.086 | 11 | 0.014 | 17 | 0.007 | 19 | 0.007 | FGA | 8 | 0.343 | 10 | 0.043 | 26 | 0.007 | 13 | 0.236 | 12 | 0.007 | D16S539 | 28 | 0.050 | A | F | 9 | 0.107 | 11 | 0.214 | D12S391 | 14 | 0.207 | 13 | 0.143 | A | F | 29 | 0.257 | 18 | 0.021 | 10 | 0.129 | 12 | 0.086 | A | F | 15 | 0.021 | 14 | 0.221 | 6 | 0.007 | 30 | 0.279 | 19 | 0.029 | 11 | 0.207 | 13 | 0.057 | 15 | 0.029 | 17 | 0.021 | 15 | 0.236 | 9 | 0.264 | 31 | 0.121 | 20 | 0.036 | 12 | 0.186 | 14 | 0.107 | 17 | 0.057 | 18 | 0.107 | 16 | 0.129 | 10 | 0.079 | 31.2 | 0.043 | 21 | 0.114 | 13 | 0.029 | 15 | 0.071 | 18 | 0.107 | 19 | 0.107 | 17 | 0.071 | 11 | 0.350 | 32 | 0.029 | 21.2 | 0.007 | TPOX | 16 | 0.029 | 19 | 0.257 | 20 | 0.057 | 18 | 0.036 | 12 | 0.271 | 32.2 | 0.157 | 22 | 0.214 | A | F | 17 | 0.079 | 20 | 0.179 | 20.3 | 0.021 | 19 | 0.043 | 13 | 0.021 | 33.2 | 0.050 | 23 | 0.143 | 7 | 0.007 | 18 | 0.079 | 21 | 0.171 | 21 | 0.007 | 20 | 0.021 | 14 | 0.007 | 34.2 | 0.007 | 23.2 | 0.007 | 8 | 0.521 | 19 | 0.014 | 22 | 0.114 | | | 21 | 0.029 | TH01 | | | 24 | 0.143 | 9 | 0.121 | 20 | 0.064 | 23 | 0.043 | | | 22 | 0.029 | A | F | | | 24.2 | 0.029 | 10 | 0.007 | 21 | 0.007 | 24 | 0.029 | | | 23 | 0.007 | 6 | 0.071 | | | 25 | 0.136 | 11 | 0.343 | 22 | 0.007 | 25 | 0.014 | | | | | 7 | 0.257 | | | 25.2 | 0.021 | | | 24 | 0.014 | | | | | | | 8 | 0.036 | | | 26 | 0.079 | | | | | | | | | | | 9 | 0.579 | | | | | | | | | | | | | | | 9.3 | 0.021 | | | | | | | | | | | | | | | 10 | 0.036 |
| 表 1 广西瑶族人群18个STR基因座的等位基因频率(n=70) Table 1 The allele frequencies of 18 STR loci of Yao population in Guangxi(n=70) |
表 2
Table 2
表 2(Table 2)
 表 2 广西苗族人群18个STR基因座的等位基因频率(n=68) Table 2 The alleles frequencies of 18 STR loci of Miao population in Guangxi(n=68)D5S818 | D8S1179 | D7S820 | CSF1PO | D2S1338 | D3S1358 | vWA | D19S433 |
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A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | A | F | 7 | 0.015 | 8 | 0.007 | 7 | 0.007 | 9 | 0.022 | 16 | 0.037 | 14 | 0.029 | 14 | 0.324 | 12.2 | 0.007 | 9 | 0.066 | 10 | 0.206 | 8 | 0.147 | 10 | 0.199 | 17 | 0.066 | 15 | 0.353 | 15 | 0.029 | 13 | 0.235 | 10 | 0.250 | 11 | 0.103 | 9 | 0.022 | 11 | 0.191 | 18 | 0.081 | 16 | 0.309 | 16 | 0.154 | 13.2 | 0.088 | 11 | 0.301 | 12 | 0.176 | 9.1 | 0.007 | 12 | 0.529 | 19 | 0.154 | 17 | 0.250 | 17 | 0.147 | 14 | 0.272 | 12 | 0.206 | 13 | 0.221 | 10 | 0.118 | 13 | 0.051 | 20 | 0.066 | 18 | 0.051 | 18 | 0.228 | 14.2 | 0.096 | 13 | 0.162 | 14 | 0.096 | 11 | 0.449 | 14 | 0.007 | 21 | 0.037 | 19 | 0.007 | 19 | 0.096 | 15 | 0.074 | D21S11 | 15 | 0.154 | 11.1 | 0.007 | PentaE | 22 | 0.074 | D6S1043 | 20 | 0.022 | 15.2 | 0.184 | A | F | 16 | 0.037 | 12 | 0.176 | A | F | 23 | 0.184 | A | F | D18S51 | 16 | 0.015 | 28 | 0.007 | FGA | 13 | 0.066 | 5 | 0.015 | 24 | 0.184 | 10 | 0.125 | A | F | 16.2 | 0.029 | 29 | 0.265 | A | F | D13S317 | 10 | 0.029 | 25 | 0.103 | 11 | 0.088 | 12 | 0.044 | D16S539 | 30 | 0.287 | 18 | 0.022 | A | F | 11 | 0.257 | 26 | 0.015 | 12 | 0.110 | 13 | 0.096 | A | F | 31 | 0.103 | 19 | 0.037 | 8 | 0.316 | 12 | 0.081 | D12S391 | 13 | 0.118 | 14 | 0.147 | 8 | 0.007 | 31.2 | 0.051 | 20 | 0.051 | 9 | 0.110 | 13 | 0.118 | A | F | 14 | 0.074 | 15 | 0.162 | 9 | 0.368 | 32 | 0.015 | 21 | 0.125 | 10 | 0.184 | 14 | 0.044 | 15 | 0.007 | 15 | 0.015 | 16 | 0.206 | 10 | 0.132 | 32.2 | 0.169 | 21.2 | 0.022 | 11 | 0.250 | 15 | 0.066 | 17 | 0.051 | 17 | 0.022 | 17 | 0.14 | 11 | 0.265 | 33.2 | 0.081 | 22 | 0.250 | 12 | 0.110 | 16 | 0.103 | 18 | 0.176 | 18 | 0.228 | 18 | 0.051 | 12 | 0.154 | 34.2 | 0.007 | 22.2 | 0.007 | 13 | 0.015 | 17 | 0.051 | 19 | 0.228 | 19 | 0.191 | 19 | 0.066 | 13 | 0.074 | 35.2 | 0.015 | 23 | 0.125 | 14 | 0.015 | 18 | 0.037 | 20 | 0.140 | 20 | 0.015 | 20 | 0.029 | TH01 | | | 23.2 | 0.007 | TPOX | 19 | 0.066 | 21 | 0.221 | 20.3 | 0.007 | 21 | 0.007 | A | F | | | 24 | 0.074 | A | F | 20 | 0.059 | 22 | 0.110 | 21 | 0.007 | 22 | 0.044 | 6 | 0.088 | | | 24.2 | 0.029 | 8 | 0.397 | 21 | 0.044 | 23 | 0.029 | | | 24 | 0.007 | 7 | 0.272 | | | 25 | 0.110 | 9 | 0.118 | 22 | 0.015 | 24 | 0.022 | | | | | 8 | 0.037 | | | | | 10 | 0.066 | 24 | 0.015 | 25 | 0.015 | | | | | 9 | 0.537 | | | | | 11 | 0.412 | | | | | | | | | 9.3 | 0.022 | | | | | 12 | 0.007 | | | | | | | | | 10 | 0.044 |
| 表 2 广西苗族人群18个STR基因座的等位基因频率(n=68) Table 2 The alleles frequencies of 18 STR loci of Miao population in Guangxi(n=68) |
表 3
Table 3
表 3(Table 3)
 表 3 广西瑶族和苗族人群18个STR基因座法医遗传学参数 Table 3 Genetic parameters of 18 STR loci of Yao and Miao population in Guangxi | 广西瑶族人群(n=70) | | 广西苗族人群(n=68) |
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基因座 | H | PM | DP | PIC | PE | | H | PM | DP | PIC | PE | D5S818 | 0.814 | 0.096 | 0.904 | 0.740 | 0.626 | | 0.824 | 0.104 | 0.896 | 0.740 | 0.643 | D21S11 | 0.900 | 0.077 | 0.923 | 0.780 | 0.795 | | 0.750 | 0.080 | 0.920 | 0.770 | 0.510 | D7S820 | 0.757 | 0.107 | 0.893 | 0.700 | 0.522 | | 0.735 | 0.112 | 0.888 | 0.690 | 0.485 | CSF1PO | 0.714 | 0.160 | 0.840 | 0.640 | 0.451 | | 0.603 | 0.176 | 0.824 | 0.590 | 0.294 | D2S1338 | 0.900 | 0.047 | 0.953 | 0.840 | 0.795 | | 0.956 | 0.044 | 0.956 | 0.860 | 0.910 | D3S1358 | 0.700 | 0.142 | 0.858 | 0.660 | 0.428 | | 0.662 | 0.141 | 0.859 | 0.660 | 0.372 | vWA | 0.729 | 0.084 | 0.916 | 0.740 | 0.474 | | 0.809 | 0.086 | 0.914 | 0.760 | 0.616 | D8S1179 | 0.857 | 0.056 | 0.944 | 0.820 | 0.709 | | 0.912 | 0.068 | 0.932 | 0.810 | 0.820 | D16S539 | 0.671 | 0.118 | 0.882 | 0.680 | 0.385 | | 0.721 | 0.102 | 0.898 | 0.710 | 0.461 | PentaE | 0.886 | 0.029 | 0.971 | 0.890 | 0.766 | | 0.853 | 0.032 | 0.968 | 0.870 | 0.701 | TPOX | 0.586 | 0.233 | 0.767 | 0.520 | 0.274 | | 0.691 | 0.215 | 0.785 | 0.590 | 0.415 | TH01 | 0.571 | 0.218 | 0.782 | 0.540 | 0.258 | | 0.662 | 0.218 | 0.782 | 0.580 | 0.372 | D19S433 | 0.843 | 0.059 | 0.941 | 0.800 | 0.681 | | 0.779 | 0.068 | 0.932 | 0.790 | 0.561 | D18S51 | 0.814 | 0.056 | 0.944 | 0.830 | 0.626 | | 0.912 | 0.042 | 0.958 | 0.860 | 0.820 | FGA | 0.943 | 0.052 | 0.948 | 0.860 | 0.884 | | 0.912 | 0.040 | 0.960 | 0.860 | 0.820 | D6S1043 | 0.814 | 0.047 | 0.953 | 0.840 | 0.626 | | 0.809 | 0.040 | 0.960 | 0.840 | 0.616 | D13S317 | 0.743 | 0.086 | 0.914 | 0.740 | 0.498 | | 0.838 | 0.100 | 0.900 | 0.750 | 0.672 | D12S391 | 0.857 | 0.050 | 0.950 | 0.820 | 0.709 | | 0.853 | 0.064 | 0.936 | 0.810 | 0.701 |
| 表 3 广西瑶族和苗族人群18个STR基因座法医遗传学参数 Table 3 Genetic parameters of 18 STR loci of Yao and Miao population in Guangxi |
18个STR基因座在广西瑶族样本中检出167种等位基因, 在广西苗族样本中检出159种等位基因, 基因频率分布广西瑶族在0.007~0.579之间、广西苗族在0.007~0.537之间, 经X2检验, 所有基因座基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P> 0.05)。广西瑶族、广西苗族2个少数民族群体杂合度分别为0.571~0.943 和0.603~0.956, 个人识别率分别为0.767~0.971和0.782~0.968, 多态信息总量分别为0.520~0.890和0.580~0.870, 非父排除率分别在0.258~0.884和0.294~0.910。在两个少数民族中, D5S818、D21S11、D2S1338、vWA、D8S1179、Pen-
taE、D19S433、D18S51、FGA、D6S1043、D12S391 11个STR基因座属于高等鉴别力、高杂合度的基因座, D7S820、CSF1PO、D3S1358、D16S539、D13S317、TH01、TPOX 7个STR基因座多态性稍差[3]。参照文献[4]的方法计算广西瑶族、广西苗族18个STR基因座的累积随机匹配概率(PM)分别为2.40× 10-20和2.66× 10-20; 累积个体识别力(TDP)分别为0.999 999 999 999 999 999 976 02和0.999 999 999 999 999 999 973 38; 累积非父排除概率(CEP)分别为0.999 999 978 8和0.999 999 992 1, 适合于两群体的个人识别和亲子鉴定。
等位基因频率具有地区和民族差异, 是因交通不便导致地理隔离或族内婚姻为主, 少与外族通婚, 在长时间积累下形成群体间的遗传差异[5]。不同地区和民族相同STR位点的等位基因分布存在一定差异, 使得不同人群之间的基因频率分布资料不宜混用, 所以获取各群体STR基因座的等位基因频率是必要的和有意义的[6]。本文报道的广西瑶族和苗族常染色体STR遗传多态性数据, 所调查的群体数据达到了法医学上的遗传平衡, 数据可信性高, 同时也为广西瑶族和广西苗族群体STR数据资料的完善, 法医人类学和法医遗传学的有关研究提供了基础数据。