引用本文
周晶, 牛一平, 杜潇. .石家庄地区汉族人群18个STR基因座遗传多态性调查[J]. 刑事技术,2015,40(3): 244-245
ZHOU Jing, NIU Yiping, DU Xiao. .Genetic Polymorphism of 18 STR Loci of Han Population in Shijiazhuang[J].
Forensic Science and Technology ,2015,40(3): 244-245
10.16467/j.1008-3650.2015.03.019
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石家庄地区汉族人群18个STR基因座遗传多态性调查
周晶
, 牛一平, 杜潇
作者简介:周 晶(1976—),女,河北临西人,副主任法医师 ,学士,研究方向为法医遗传学。 E-mail:zjwy2004@126.com
摘要
目的 调查石家庄汉族人群18个STR基因座的遗传多态性。方法 应用DNA TyperTM 15 Plus荧光标记复合扩增系统检测323名石家庄地区汉族无关个体18个STR基因座多态性,计算群体遗传学参数。结果 18个STR基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),共检出198个等位基因, 695个基因型,12个微变异等位基因。结论 18个STR基因座在石家庄汉族人群中有较高的遗传多态性。
关键词 :
法医遗传学 ; STR基因座 ; 遗传多态性 ; 石家庄地区 ; 汉族
doi: 10.16467/j.1008-3650.2015.03.019
Genetic Polymorphism of 18 STR Loci of Han Population in Shijiazhuang
ZHOU Jing
, NIU Yiping, DU Xiao
Institute of Forensic Science, Shijiazhuang Public Security Bureau, Shijiazhuang 050021,China
Abstract
Objective To investigate genetic polymorphism of 18 STR loci on human chromosomes of Han population in Shijiazhuang.Methods Allelic frequencies for 18 STR loci and genetic parameters for forensic purpose were calculated.Results No deviations of allelic frequency from Hardy-Weinberg equilibrium expectations were observed (P>0.05). 198 alleles and 695 genotypes were gained. Allele frequencies varied between 0.002 and 0.545; heterozygosity (H) between 0.624 and 0.932; matching probability (Pm) between 0.016 and 0.189; power of discrimination (DP) between 0.811 and 0.984; polymorphism information content (PIC) between 0.580 and 0.910; power exclusion (PE) between 0.321 and 0.861. 12 off-ladder alleles of 8 STR loci were found.Conclusions 18 STR loci of Han population in Shijiazhuang are with relatively high polymorphism, and suitable for forensic individual identification, paternity testing, and relative research.
Keyword :
forensic genetics ; STR loci ; genetic polymorphism ; Shijiazhuang area ; Han population
应用DNA TyperTM 15 Plus扩增试剂盒(公安部物证鉴定中心)对石家庄地区323名汉族无关人群18个基因座(CSF1PO、D2S1338、D3S1358、D5S818、D6S1043、D7S820、D8S1179、D12S391、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11、FGA、PentaE、TH01、TPOX、vWA)进行调查, 用Modified-Powerstates分析软件进行统计学计算[1 ] , 应用Hardy-Weinberg平衡软件对各个基因座数据进行χ 2 检验[2 ] , 获得了该地区汉族群体遗传学数据(见表1 、表2 )。
表 1
Table 1
表 1(Table 1)
表 1 石家庄汉族人群18个STR基因座法医学遗传参数(n=323) Table 1 Genetic parameters of 18 STR loci of Han population in Shijiazhuang (n=323) 基因座 H Pm DP PIC PE 基因座 H Pm DP PIC PE D8S1179 0.836 0.050 0.950 0.820 0.667 D12S391 0.827 0.049 0.951 0.810 0.649 D21S11 0.858 0.068 0.932 0.790 0.710 D2S1338 0.876 0.034 0.966 0.850 0.747 D7S820 0.765 0.087 0.913 0.740 0.535 D19S433 0.802 0.061 0.939 0.780 0.602 CSF1PO 0.765 0.110 0.890 0.700 0.535 vWA 0.817 0.068 0.932 0.780 0.632 D3S1358 0.731 0.139 0.861 0.660 0.477 TPOX 0.624 0.184 0.816 0.580 0.321 TH01 0.653 0.189 0.811 0.580 0.360 D18S51 0.842 0.046 0.954 0.830 0.679 D13S317 0.768 0.072 0.928 0.770 0.541 D5S818 0.796 0.095 0.905 0.730 0.591 D16S539 0.783 0.078 0.922 0.750 0.568 FGA 0.858 0.042 0.958 0.830 0.710 D6S1043 0.864 0.032 0.968 0.860 0.722 PentaE 0.932 0.016 0.984 0.910 0.861
表 1 石家庄汉族人群18个STR基因座法医学遗传参数(n=323) Table 1 Genetic parameters of 18 STR loci of Han population in Shijiazhuang (n=323)
表 2
Table 2
表 2(Table 2)
表 2 石家庄地区汉族人群18个STR基因座等位基因频率 (n=323) Table 2 Allele Frequency of 18 STR loci of Han population in Shijiazhuang (n=323) D8S1179 CSF1PO D21S11 THO1 D6S1043 PentaE FGA A F A F A F A F A F A F A F 8 0.002 7 0.003 27 0.006 6 0.096 9 0.002 5 0.051 14 0.002 10 0.105 8 0.005 28 0.042 7 0.251 10 0.029 7 0.003 18 0.019 11 0.080 9 0.050 28.2 0.006 8 0.050 11 0.104 8 0.006 19 0.040 12 0.119 10 0.265 29 0.269 9 0.545 12 0.127 9 0.009 20 0.053 13 0.245 11 0.240 30 0.282 9.3 0.043 13 0.149 10 0.045 21 0.110 14 0.195 12 0.342 30.2 0.015 10 0.015 14 0.132 11 0.125 21.2 0.005 15 0.161 13 0.076 30.3 0.005 D19S433 15 0.017 12 0.107 22 0.166 16 0.076 14 0.017 31 0.108 A F 16 0.002 13 0.051 22.2 0.005 17 0.017 15 0.003 31.2 0.080 12 0.036 17 0.045 14 0.093 23 0.259 D2S1338 D5S818 32 0.028 12.2 0.002 18 0.161 15 0.091 23.2 0.014 A F A F 32.2 0.110 13 0.307 19 0.176 16 0.088 24 0.176 15 0.002 7 0.020 33 0.002 13.2 0.039 20 0.039 17 0.062 24.2 0.006 16 0.011 8 0.002 33.2 0.043 14 0.231 20.3 0.003 18 0.108 25 0.088 17 0.065 9 0.077 34.2 0.003 14.2 0.125 21 0.014 19 0.050 25.2 0.005 18 0.124 10 0.166 D13S317 15 0.054 22.3 0.002 20 0.056 26 0.048 19 0.159 11 0.337 A F 15.2 0.149 D18S51 21 0.026 26.2 0.002 20 0.105 12 0.254 8 0.238 16 0.012 A F 22 0.011 27 0.005 21 0.019 13 0.138 9 0.113 16.2 0.040 11 0.002 23 0.006 vWA 22 0.045 14 0.005 10 0.138 17.2 0.005 12 0.033 24 0.006 A F 23 0.217 15 0.002 11 0.283 18.2 0.002 13 0.235 25 0.002 13 0.002 24 0.147 D12S391 12 0.184 D7S820 14 0.211 26 0.003 14 0.255 25 0.076 A F 13 0.034 A F 15 0.181 TPOX 15 0.046 26 0.022 15 0.015 14 0.008 7 0.003 16 0.111 A F 16 0.181 27 0.003 16 0.005 15 0.002 8 0.128 17 0.065 8 0.488 17 0.237 28 0.005 17 0.108 D16S539 9 0.051 18 0.045 9 0.146 18 0.167 29 0.002 18 0.241 A F 9.1 0.003 19 0.042 10 0.019 19 0.098 D3S1358 19 0.232 8 0.011 9.2 0.002 20 0.029 11 0.312 20 0.014 A F 20 0.152 9 0.280 10 0.170 21 0.026 12 0.033 14 0.037 21 0.115 10 0.115 11 0.307 22 0.011 13 0.003 15 0.365 22 0.076 11 0.228 12 0.289 23 0.005 16 0.320 23 0.025 12 0.238 13 0.039 24 0.005 17 0.209 24 0.020 13 0.110 14 0.008 18 0.065 25 0.008 14 0.019 19 0.003 26 0.003
表 2 石家庄地区汉族人群18个STR基因座等位基因频率 (n=323) Table 2 Allele Frequency of 18 STR loci of Han population in Shijiazhuang (n=323)
18个STR基因座, 共检测到198个等位基因, 其频率在0.002~0.545之间, 共695个基因型。在8个基因座上检出12个微变异等位基因(OL), 其频率均小于0.005(见表3 ), 对于法医的个体识别及亲子鉴定具有一定的意义。各基因座的H值分布在0.624~0.932之间, DP值0.811~0.984, PE值0.321~0.861, PIC值0.580~0.910, 累计匹配率为5.736× 10-22 , 累计个体识别率达到0.999 999 999 999 999 999 999 426, 三联体的累计非父排除概率0.999 999 973 339。
表 3
Table 3
表 3(Table 3)
表 3 石家庄地区汉族人群18个STR基因座的微变异等位基因情况 Table 3 Variant alleles of 18 STR loci of Han population in Shijiazhuang D21S11 D6S1043 PentaE FGA D2S1338 D7S820 D19S433 D13S317 OL F OL F OL F OL F OL F OL F OL F OL F 30.3 0.005 9 0.002 25 0.002 14 0.002 29 0.002 9.1 0.003 18.2 0.002 15 0.002 22.3 0.002 26 0.003 9.2 0.002 17.2 0.005
表 3 石家庄地区汉族人群18个STR基因座的微变异等位基因情况 Table 3 Variant alleles of 18 STR loci of Han population in Shijiazhuang
The authors have declared that no competing interests exist.
参考文献
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赵方 , 伍新尧 , 蔡贵庆 , 等 . Modified-Powerstates软件在法医生物统计中应用 [J]. 中国法医学杂志 , 2003 , 18 (5 ): 297 -298, 312 .
采用DNA分型进行个体识别和亲权鉴定必须选择适合相应民族与群体的基因座(以下简称位点)及建立相应民族与群体DNA分型的基础数据库.
... 应用DNA TyperTM 15 Plus扩增试剂盒(公安部物证鉴定中心)对石家庄地区323名汉族无关人群18个基因座(CSF1PO、D2S1338、D3S1358、D5S818、D6S1043、D7S820、D8S1179、D12S391、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11、FGA、PentaE、TH01、TPOX、vWA)进行调查,用Modified-Powerstates分析软件进行统计学计算[1 ] ,应用Hardy-Weinberg平衡软件对各个基因座数据进行#cod#x003c7 ...
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... 2 检验[2 ] ,获得了该地区汉族群体遗传学数据(见表1 、表2 ) ...