引用本文
魏福军, 赵兴春, 张建, 王天华, 贾世友, 高靖宇, 王娜. 大庆地区汉族群体18个STR基因座遗传多态性[J]. 刑事技术,2014,39(6): 44-46
WEI Fu-jun, ZHAO Xing-chun, ZHANG Jian, WANG Tian-hua, JIA Shi-you, GAO Jing-yu, WANG Na. Polymorphism of 18 short tandem repeat loci in han population of daqing district[J]. Forensic Science and Technology,2014,39(6): 44-46  
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大庆地区汉族群体18个STR基因座遗传多态性
魏福军1, 赵兴春2, 张建2, 王天华1, 贾世友1, 高靖宇1, 王娜1
1.大庆市公安局刑事技术支队,黑龙江省 163311
2.公安部物证鉴定中心,北京 100038

作者简介:魏福军(1975—),男,山东人,主检法医师,本科,主要从事法医学DNA检验鉴定工作。Tel:18945600736; E-mail:wfj0000@163.com

摘要

目的 调查大庆地区汉族人群18个STR基因座的遗传多态性。方法 应用DNATyperTM19试剂盒检测221名大庆地区汉族无关个体18个STR基因座的等位基因频率,并应用统计软件计算群体遗传学参数。结果 18个STR 基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡( P > 0.05),18个基因座的杂合度(H)在0.608~0.896之间,匹配概率(Pm)在0.016~0.196之间,个体识别概率(DP)在0.804~0.984之间,多态信息含量(PIC)在0.560~0.910之间,非父排除概率(PE)值在0.301~0.788之间。结论 18个STR基因座在大庆汉族人群中有较高的多态性,所得的群体遗传学数据可为大庆地区刑事案件的法医学的个体识别、亲权鉴定和群体遗传学研究提供基础数据。

关键词: DNATyperTM19试剂盒; STR基因座; 遗传多态性; 汉族
中图分类号:DF795.2 文献标志码:A 文章编号:1008-3650(2014)05-0044-03
Polymorphism of 18 short tandem repeat loci in han population of daqing district
WEI Fu-jun, ZHAO Xing-chun, ZHANG Jian, WANG Tian-hua, JIA Shi-you, GAO Jing-yu, WANG Na
Abstract

Objective To investigate the polymorphism of 18 STR loci in Han population from Daqing district. Methods DNATyperTM19 kit was used to detect the allelic frequencies of 18 STR loci in 221 unrelated Daqing Han individuals, and then the population genetics parameters were calculate by using statistic software. Results The results demonstrated that all loci were found to be no deviation from Hardy-Weinberg equilibrium ( P>0.05), Heterozygosity (H) ranged from 0.608 to 0.896, matching probability (Pm) ranged from 0.016 to 0.196, power of discrimination (DP) ranged from 0.804 to 0.984, polymorphism information content (PIC) ranged from 0.560 to 0.910, power of exclusion (PE) ranged from 0.301 to 0.788. Conclusions The 18 STR loci are relatively abundant in polymorphic information and suitable for forensic personal identification and paternity testing.

Keyword: DNATyperTM19 kit; STR loci; polymorphism; Han population

本文应用DNATyperTM19直扩试剂盒检验大庆市前科人员样本DNA分型, 并调查该地区汉族人群18个STR基因座的遗传多态性。为大庆地区刑事案件的法医学的个体识别、亲权鉴定和群体遗传学研究提供基础数据。

1 材料与方法
1.1 实验样本

从大庆市违法犯罪人员数据库筛选获得221份大庆地区汉族个体血样, 通过对户籍地及STR分型的比对, 排除样品间存在同户、同卵双生及单亲遗传关系。血样采集载体均为纸质类型(博坤公司研制口腔细胞采集卡)。

1.2 扩增及检测

样本的扩增按照DNATyperTM19试剂盒(公安部物证鉴定中心)说明书进行操作[1, 2], 在AB3130型遗传分析仪上进行电泳, 使用GeneMapper ID v3.2软件进行基因型分析。

1.3 统计学分析

应用Power Stars分析软件[3, 4]统计各基因座的等位基因频率、杂合度(H)、个体识别概率(DP)、匹配概率(Pm)、非父排除概率(PE)和多态性信息含量(PIC)等法医遗传学参数, 并计算累积个体识别率(TDP)和累积非父排除率(CPE); 应用Hardy-Weinberg平衡软件对各基因座的基因型数据进行χ 2检验[5]。

2 结果与讨论

大庆地区人群221名无关个体18个STR基因座等位基因频率分布见表1。18个STR基因座在221名大庆汉族群体中检出206个等位基因, 617个基因型。经χ 2检验, 所有基因座型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P > 0.05)。

表1 大庆汉族人群18个STR基因座等位基因频率(n=221)
表2 大庆汉族人群18个STR基因座法医遗传学参数(n=221)

应用基因频率、基因型频率计算各基因座杂合度(H)、匹配概率(Pm)、多态信息含量(PIC)、个人识别率(DP)和非父排除概率(PE)的值, 结果见表2。由该表可知, 大庆汉族人群的H值在0.608~0.896之间, 匹配概率(Pm)在0.016~0.196之间, DP在0.804~0.984之间, PIC在0.560~0.910之间, PE在0.301~0.788之间。其中Penta E的H、PIC、DP、PE值最大, 而TPOX的值最小。说明对于大庆汉族人群来说, 该18个STR基因座中Penta E的多态性程度最高, 应用于法医学个体识别及亲子鉴定效能最高, 相反, TPOX最低。

The authors have declared that no competing interests exist.

参考文献
[1] 张建, 姜成涛, 赵兴春, 等. DNATyperTM15试剂盒直接扩增检验纸质样本的研究[J]. 刑事技术, 2011(4): 33-35. [本文引用:1]
[2] S. T. Kalinowski, M. L. Taper， T. C. Marshall. Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment[J]. Mol. Ecol, 2007, 16(5): 1006-1099. [本文引用:1]
[3] Power Stats. http://www.promega.com/geneticidtools/.1999. [本文引用:1]
[4] 郑秀芬. 法医DNA 分析[M]. 北京: 中国人民公安大学出版社, 2002: 385-387. [本文引用:1]