引用本文
刘亚举, 张俊涛, 史绍杏, 刘海, 郭利红, 张毅, 李效阳. 河南汉族人群27个Y-STR基因座遗传多态性[J]. 刑事技术,2014,39(4): 18-20
LIU Ya-ju, ZHANG Jun-tao, SHI Shao-xing, LIU Hai, GUO Li-hong, ZHANG Yi, LI Xiao-yang. Genetic polymorphisms of 27 Y-STR loci in Henna Han population[J].
Forensic Science and Technology ,2014,39(4): 18-20
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《刑事技术》编辑部
河南汉族人群27个Y-STR基因座遗传多态性
刘亚举
1 , 张俊涛
2 , 史绍杏
3 , 刘海
4 , 郭利红
4 , 张毅
4 , 李效阳
4
作者简介:刘亚举(1978—),男,河南襄城人,副主任法医师,学士,主要从事法医DNA检验鉴定及研究工作。Tel:18637461127; E-mail:horse3697@126.com
摘要
目的 调查27个Y-STR基因座在河南汉族男性人群中的遗传多态性。方法 应用Yfiler○R Plus试剂盒,对河南地区1100名汉族男性无关个体血样进行PCR扩增,3500XL型遗传分析仪电泳检测,GeneMapperID-X软件进行等位基因分型。结果 1100名男性共检出1098种不同的单倍型,其中1094种为单一型,另有3种单倍型均检出2例, HD(单倍型)值为0.999995;27个Y-STR基因座的GD值为0.3833~0.9663。结论 27个Y-STR基因座多数在河南汉族男性人群中有较好分布,对法医学应用和人类群体遗传学研究具有重要价值。
关键词 :
法医物证学 ; Y-STR基因座 ; 遗传多态性 ; 河南汉族
中图分类号:DF795.2
文献标志码:A
文章编号:1008-3650(2014)04-0018-03
Genetic polymorphisms of 27 Y-STR loci in Henna Han population
LIU Ya-ju
, ZHANG Jun-tao, SHI Shao-xing, LIU Hai, GUO Li-hong, ZHANG Yi, LI Xiao-yang
Abstract
In this paper,polymorphisms of 27 Y-STR Loci in Henna Han population was investigated. Results revealed that the HD (haplotype diversity) was 0.999995, the GD(gene diversity) of the 27 Y-STRs ranged from 0.3833(DYS391) to 0.9663 (DYS385).Therefore the most of 27 Y-STRs loci were valuable in the application of forensic medicine and population genetics.
Keyword :
forensic science ; Y-STR loci ; genetic polymorphisms ; Henan Han nationality
人类Y染色体是男性特有并呈父系、单倍型遗传的特征, 在法医学检验中作用独特。本文采用Yfiler○R Plus VTS(AB公司, 美国)荧光标记复合扩增系统, 对河南汉族人群27个Y-STR基因座的遗传多态性进行调查, 旨在为法医学应用及群体遗传学研究提供基础数据。
1 材料与方法 1.1 样 本 1100例居住河南、无父系亲缘关系的汉族男性个体的纸质血样(取自实验室日常检案积累)。
1.2 PCR扩增和电泳检测与分型 采用Yfiler○R Plus VTS在AB 9700型热循环仪上以9600升降温模式进行复合扩增, 反应体系为10μ L, 其中Master Mix 4μ L, Primer Set 2μ L, 纯水4μ L, 1.2mm圆孔血样。热循环参数为:95℃ 1min; 94℃ 4s, 61℃ 1min, 27个循环; 60℃ 22min; 4℃保温。然后取1μ L扩增产物与0.5μ L内标Liz-600和9.5μ L去离子甲酰胺混合, 95℃变性3min后, 冰浴3min, 置3500XL型遗传分析仪上全自动毛细管电泳, Collection软件收集数据, 用GeneMapperID-X软件进行等位基因分型。
1.3 统计分析 用直接计数法计算各个基因座的等位基因频率和单倍型频率、基因多样性(GD)及单倍型多样性(HD), 其中GD计算公式:GD=[n(1-∑ P i 2 [1 。(式中n为样本数, Pi 为基因频率或单倍型频率)。对于Y染色体来说, GD值即等于个体识别能力和非父排除率[2 。
2 结果与讨论 1100名河南汉族无关男性个体27个Y-STR基因座的等位基因频率及GD值见表1 。
表1 数据显示, 27个Y-STR基因座共被检出1098种单倍型, 累计GD值达0.999995。其中检出单倍型最多的是DYS385基因座(70种), DYF387S1基因座次之(50种), 其余基因座分别检出4~19种不等的单倍型。GD值最高的为DYS385基因座(0.9663), 最低的为DYS391基因座(0.3833)。本文结果提示, 27个Y-STR基因座在法医学上有重要应用价值, 适合于性犯罪案件中混合斑男性成分检测及家系排查。
表1
表1
表1 河南汉族27个Y-STR基因座等位基因频率分布与GD值 DYS389I DYS460 DYS533 GATA-H4 DYS391 DYS456 DYS390 DYS438 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 11 0.0350 8 0.0045 9 0.0027 8 0.0009 6 0.0009 12 0.0055 21 0.0064 8 0.0018 12 0.5073 9 0.3345 10 0.0645 9 0.0009 8 0.0009 13 0.0291 22 0.0945 9 0.0118 13 0.3068 9.1 0.0009 11 0.5145 10 0.0700 9 0.0555 14 0.1427 23 0.4200 10 0.6564 14 0.1473 10 0.3705 12 0.3209 11 0.3418 10 0.7636 15 0.5986 24 0.3136 11 0.2764 15 0.0027 11 0.2659 13 0.0818 12 0.4909 11 0.1755 16 0.1650 25 0.1427 12 0.0473 16 0.0009 12 0.0227 14 0.0155 13 0.0900 12 0.0036 17 0.0536 26 0.0209 13 0.0064 13 0.0009 14 0.0055 18 0.0055 27 0.0018 DYS576 DYS635 DYS389II DYS19 DYS448 DYS392 DYS439 DYS393 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 13 0.0009 18 0.0009 24 0.0009 12 0.0018 16 0.0018 7 0.0036 8 0.0009 7 0.0009 14 0.0018 19 0.1073 25 0.0018 13 0.0464 17 0.0382 10 0.0155 9 0.0027 11 0.0018 15 0.0082 20 0.2755 26 0.0127 14 0.2718 18 0.1445 11 0.1527 10 0.0500 12 0.5491 16 0.0973 21 0.3209 27 0.0755 15 0.4219 18.2 0.0009 12 0.1709 11 0.3873 13 0.2245 17 0.1709 22 0.1700 28 0.3000 16 0.1945 19 0.3936 13 0.2464 12 0.3700 14 0.1728 18 0.3068 23 0.0918 29 0.3418 17 0.0609 19.2 0.0027 14 0.3600 13 0.1682 15 0.0491 19 0.2914 24 0.0291 30 0.1900 18 0.0018 20 0.2627 15 0.0436 14 0.0191 16 0.0018 20 0.1064 25 0.0045 31 0.0636 19 0.0009 21 0.1382 16 0.0073 15 0.0018 21 0.0136 32 0.0118 22 0.0173 22 0.0027 33 0.0018 DYS449 DYS458 DYS481 DYS570 DYS518 DYS518 DYS627 DYS627 DYS437 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 25 0.0036 14 0.0191 20 0.0118 10 0.0009 32 0.0027 40.2 0.0009 15 0.0009 25 0.0073 13 0.0055 26 0.0200 14.1 0.0018 21 0.0382 14 0.0127 33 0.0173 41 0.0345 16 0.0091 25.1 0.0009 14 0.6073 27 0.0355 15 0.1127 22 0.2027 15 0.0264 34 0.0327 42 0.0200 17 0.0418 26 0.0018 15 0.3609 28 0.0745 16 0.1791 23 0.2982 16 0.1936 34.3 0.0018 43 0.0118 17.2 0.0009 16 0.0264 29 0.1209 17 0.2773 24 0.2473 17 0.2082 35 0.1173 18 0.1209 30 0.1100 18 0.2355 25 0.1218 18 0.2118 35.2 0.0009 18.1 0.0009 31 0.1836 18.2 0.0009 25.1 0.0009 19 0.2036 36 0.2164 18.2 0.0027 32 0.1445 19 0.1082 26 0.0473 20 0.1245 36.2 0.0018 19 0.1600 33 0.1323 20 0.0382 27 0.0164 21 0.0136 37 0.1273 20 0.1327 34 0.1132 20.2 0.0009 28 0.0118 22 0.0045 37.2 0.0100 20.2 0.0018 35 0.0464 21 0.0227 29 0.0036 38 0.1691 21 0.2018 36 0.0091 22 0.0036 38.2 0.0236 21.1 0.0027 37 0.0036 39 0.1436 22 0.1709 38 0.0018 39.2 0.0036 23 0.0918 41 0.0009 40 0.0645 24 0.0509 DYS385(GD=0.9663) DYF387S1(GD=0.9482) 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 等位 基因 9/11 0.0009 11/20 0.0182 13/16 0.0182 15/16 0.0027 33 0.0009 36 0.0345 38/40 0.0173 10/11 0.0200 11/21 0.0018 13/17 0.0464 15/17 0.0018 33/35 0.0009 36/37 0.0673 38/41 0.0100 10/12 0.0009 11/22 0.0018 13/18 0.0573 15/18 0.0018 33/37 0.0009 36/38 0.0855 38/42 0.0018 10/13 0.0018 12 0.0445 13/19 0.0555 15/19 0.0045 34 0.0055 36/38.1 0.0027 38.1 0.0027 10/14 0.0009 12/13 0.0182 13/20 0.0273 15/20 0.0036 34/35 0.0018 36/39 0.0673 38.1/42 0.0009 10/17 0.0018 12/14 0.0145 13/21 0.0055 15/21 0.0018 34/37 0.0082 36/40 0.0200 39 0.0327 10/18 0.0036 12/15 0.0064 13/22 0.0009 15/22 0.0155 34/38 0.0100 36/41 0.0073 39/40 0.0100 10/21 0.0009 12/16 0.0418 14 0.0036 15/23 0.0109 34/39 0.0064 36/42 0.0009 39/41 0.0064 10.1/13 0.0055 12/17 0.0718 14/15 0.0009 16 0.0145 34/40 0.0073 36.1/39 0.0018 39/42 0.0064 11 0.0200 12/18 0.0455 14/16 0.0036 16/17 0.0064 35 0.0055 37 0.0682 40 0.0145 11/12 0.0273 12/19 0.0473 14/17 0.0082 16/18 0.0009 35/36 0.0073 37/38 0.0664 40/41 0.0027 11/13 0.0173 12/20 0.0200 14/18 0.0200 16/19 0.0009 35/37 0.0618 37/39 0.0564 40/42 0.0009 11/14 0.0155 12/21 0.0082 14/19 0.0100 16/20 0.0009 35/38 0.0918 37/40 0.0218 41 0.0027 11/15 0.0055 12/22 0.0036 14/20 0.0064 16/21 0.0009 35/38.1 0.0036 37/41 0.0127 41/43 0.0009 11/16 0.0182 12/23 0.0055 14/21 0.0036 17/21 0.0009 35/39 0.0518 37/42 0.0036 11/17 0.0391 13 0.0582 14/22 0.0009 18 0.0055 35/40 0.0127 37.1/40 0.0009 11/18 0.0182 13/14 0.0318 14/23 0.0027 35/41 0.0036 38 0.0536 11/19 0.0155 13/15 0.0027 15 0.0009 35/43 0.0009 38/39 0.0382
表1 河南汉族27个Y-STR基因座等位基因频率分布与GD值
The authors have declared that no competing interests exist.
参考文献
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2001
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... 对于Y染色体来说,GD值即等于个体识别能力和非父排除率[2 ] ...
, 张俊涛
